Sau cuộc chiến thảm khốc chống lại một chủng tộc người khổng lồ được gọi là Zentradi, nhân loại đã trốn thoát về phía trung tâm của thiên hà trên một hạm đội tàu thuộc địa có tên Macross Frontier. Khi mối đe dọa ngoài trái đất ngày càng bị bỏ lại phía sau, cuộc sống trên Macross Frontier vẫn diễn ra như bình thường.